Teil 4 · Statistische Inferenz und medizinische Statistik
Übungen
14 · Fehlende Werte und Imputation
Grundpfad (Aufgabe 1–6, ~45 min). Handwerk (1–2), Entscheidung (3–4), Verfahren und Imputationsmodell (5–6). Wer nur §1–§6 der Lektion gelesen hat, hört hier auf — das reicht, um fehlende Werte in einer Publikation korrekt zu behandeln.
Vertiefung (Aufgabe 7–11, ~75 min). Rubin's rules von Hand (7), Wahl von
m(8), eine Methode überführen (9), MNAR beziffern (10), Bericht (11). Rechne mit 15–20 Minuten je Aufgabe; sie sind keine Fingerübungen.
Grundpfad
Aufgabe 1 – Missingness-Tabelle
Berechne für alle Laborvariablen Anzahl und Anteil fehlender Werte. Welche zwei Variablen fehlen nennenswert?
Aufgabe 2 – Wer fehlt?
Erzeuge laktat_fehlend und bga_fehlt. Regressiere beide auf
sofa_score + verstorben_30d.
Welche Variable fehlt nach Schweregrad, welche nach Outcome? Belege es mit den Koeffizienten, nicht mit dem Bauchgefühl.
Aufgabe 3 – Die Entscheidung
Für das Modell verstorben_30d ~ laktat_mmol_l + alter + sofa_score:
- Wovon hängt das Fehlen von
laktat_mmol_lab? - Steht diese Variable im Modell?
- Ist die Complete-Case-Schätzung des Laktat-Koeffizienten damit verzerrt oder unverzerrt? Begründe.
- Und der Mittelwert von
laktat_mmol_lin einer Table 1 — verzerrt oder nicht?
Aufgabe 4 – Was Complete Case beim pH kostet
Schätze verstorben_30d ~ bga_ph + alter + sofa_score
- als Complete Case,
- auf den wahren Werten (
data/bga_ph_wahrheit.csv, nur weil die Kohorte synthetisch ist).
Vergleiche drei Größen: das Odds Ratio je 0,1 pH-Abfall, den Intercept und das vorhergesagte Risiko für eine 64-jährige Patientin mit SOFA 4 und pH 7,38.
Welche Größe überlebt die Complete-Case-Analyse, welche nicht? Warum?
Aufgabe 5 – Median-Imputation gegen multiple Imputation
Ergänze zwei weitere Schätzungen für bga_ph: Median-Imputation und multiple
Imputation (m = 20, Outcome im Imputationsmodell).
Vergleiche Odds Ratio und Standardfehler. Die Median-Imputation liefert einen kleineren Standardfehler als die Complete-Case-Analyse, obwohl sie weniger Information hat. Erkläre den Widerspruch.
Aufgabe 6 – Transfer: das Imputationsmodell sabotieren
Wiederhole die multiple Imputation, aber lasse verstorben_30d aus dem
Imputationsmodell weg (imputiere bga_ph ~ alter + sofa_score).
Vergleiche das Odds Ratio mit dem der korrekten Imputation. Was bricht — das Odds Ratio oder das absolute Risiko? Erkläre den Mechanismus und formuliere in einem Satz, warum das Imputationsmodell reicher sein muss als das Analysemodell.
Vertiefung
Aufgabe 7 – Rubin's rules von Hand
Erzeuge m = 20 vervollständigte Datensätze, fitte auf jedem
verstorben_30d ~ bga_ph + alter + sofa_score und sammle Q̂ₗ (den
pH-Koeffizienten) und Uₗ (dessen quadrierten Standardfehler).
- Berechne
Q̄,Ū,BundT = Ū + (1 + 1/m)·Bohne eine Pooling-Funktion zu benutzen. VergleicheSE = √Tmit dem, waspool()bzw.MICE.combine()ausgibt. - Berechne
r,λundRE = 1/(1 + λ/m). Was bedeutet λ inhaltlich? - Berechne die Freiheitsgrade nach Rubin (1987),
ν_alt = (m−1)/λ². Vergleiche sie mitn − k = 496. Was fällt auf? Berechne dannν_BRnach Barnard & Rubin (1999). - Setze
B = 0und rechneTerneut. Welchen Standardfehler hättest du dann berichtet — und welchem Verfahren aus §4 entspricht das?
Aufgabe 8 – Wie viele Imputationen?
- Wende die Faustregel
m ≳ 100·λ(White, Royston & Wood 2011) auf dein λ an. Reichtm = 20? - Wiederhole die Imputation für
m ∈ {2, 5, 20}mit fünf verschiedenen Seeds und notiere jeweils den gepoolten Standardfehler. - Wie stark schwankt der berichtete SE bei
m = 2gegenüberm = 20? Formuliere in einem Satz, warumm = 5heute keine gute Wahl mehr ist.
Aufgabe 9 – Transfer: eine Methode überführen
code/benchmark.py misst neun Verfahren an 500 simulierten Kohorten. Sieh dir
die Tabelle für beta_bga_ph an.
- Die deterministische Regressions-Imputation hat den kleinsten RMSE aller Einfachimputationen (0,0501) und die schlechteste Überdeckung (73,2 %). Erkläre den Widerspruch.
- Mittelwert-Imputation hat eine SE-Ratio von 1,06 — ihr Standardfehler ist also ehrlich. Warum überdeckt sie trotzdem nur 83,8 %?
- Complete Case überdeckt die Steigung zu 93,4 %, das absolute Risiko aber nur zu 57,0 %. Welche der beiden Größen würdest du in einem Prognosemodell berichten — und was folgt daraus für die Methodenwahl?
Aufgabe 10 – Klinikfall: MNAR beziffern
Eine Gutachterin schreibt: „Die Autoren nehmen MAR an. Was, wenn die Patient:innen ohne Blutgasanalyse in Wahrheit unauffälligere pH-Werte hatten?"
- Führe eine Delta-Adjustment-Analyse durch: verschiebe nur die imputierten pH-Werte um δ ∈ [−0,05; +0,05] und poole jeweils neu.
- Bestimme den Kipppunkt: das kleinste δ, bei dem das 95-%-KI die 1 einschließt.
- Setze δ ins Verhältnis zur bedingten Streuung des pH. Warum ist der Vergleich mit der Messungenauigkeit des Blutgasanalysators ein Denkfehler?
- Beantworte die Gutachterin in drei Sätzen.
Aufgabe 11 – Klinikfall: Bericht
Schreibe einen Abschnitt „Umgang mit fehlenden Werten“ für eine Publikation.
Er muss enthalten: Fehlquote pro Variable, den gemessenen Zusammenhang des
Fehlens mit anderen Variablen, die Hauptanalyse samt Imputationsmodell, m,
Seed und λ, die Sensitivitätsanalyse mit Kipppunkt und ein Urteil zur Stabilität.